MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61001	NC_017167	GTTC	2	8	3117906	3117913	0 %	50 %	25 %	25 %	384136988
61002	NC_017167	GATCTC	2	12	3117940	3117951	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384136988
61003	NC_017167	CGC	2	6	3117984	3117989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136988
61004	NC_017167	CAG	2	6	3118039	3118044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136988
61005	NC_017167	CCT	2	6	3118107	3118112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136988
61006	NC_017167	CTTCAC	2	12	3118117	3118128	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384136988
61007	NC_017167	GC	3	6	3118138	3118143	0 %	0 %	50 %	50 %	384136988
61008	NC_017167	CCT	2	6	3118161	3118166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136988
61009	NC_017167	AGC	2	6	3118289	3118294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136988
61010	NC_017167	TCG	2	6	3118328	3118333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136988
61011	NC_017167	ATC	2	6	3118334	3118339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136988
61012	NC_017167	TTC	2	6	3118378	3118383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136988
61013	NC_017167	GCG	2	6	3118400	3118405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136988
61014	NC_017167	ATG	2	6	3118418	3118423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136988
61015	NC_017167	CGC	2	6	3118432	3118437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136988
61016	NC_017167	CTC	2	6	3118438	3118443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136988
61017	NC_017167	CGTTC	2	10	3118453	3118462	0 %	40 %	20 %	40 %	384136988
61018	NC_017167	CGG	2	6	3118470	3118475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136988
61019	NC_017167	CGT	2	6	3118536	3118541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136988
61020	NC_017167	GCA	2	6	3118563	3118568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136988
61021	NC_017167	CG	3	6	3118573	3118578	0 %	0 %	50 %	50 %	384136988
61022	NC_017167	ATGGA	2	10	3118592	3118601	40 %	20 %	40 %	0 %	384136988
61023	NC_017167	TCC	2	6	3118619	3118624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136988
61024	NC_017167	TCG	2	6	3118632	3118637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136988
61025	NC_017167	TCGCGA	2	12	3118703	3118714	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384136988
61026	NC_017167	GTCCC	2	10	3118755	3118764	0 %	20 %	20 %	60 %	384136988
61027	NC_017167	CGC	2	6	3118773	3118778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136988
61028	NC_017167	GCG	2	6	3118785	3118790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136988
61029	NC_017167	GAT	2	6	3118810	3118815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136988
61030	NC_017167	TCC	2	6	3118826	3118831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136988
61031	NC_017167	CAGC	2	8	3118843	3118850	25 %	0 %	25 %	50 %	384136988
61032	NC_017167	GT	3	6	3118872	3118877	0 %	50 %	50 %	0 %	384136988
61033	NC_017167	GAAA	2	8	3118885	3118892	75 %	0 %	25 %	0 %	384136988
61034	NC_017167	AATC	2	8	3118938	3118945	50 %	25 %	0 %	25 %	384136988
61035	NC_017167	TTG	2	6	3118952	3118957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136988
61036	NC_017167	CGA	2	6	3119007	3119012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136988
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61038	NC_017167	CAC	2	6	3119116	3119121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136988
61039	NC_017167	CTC	2	6	3119191	3119196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136988
61040	NC_017167	GTTC	2	8	3119228	3119235	0 %	50 %	25 %	25 %	384136988
61041	NC_017167	GTA	2	6	3119260	3119265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136988
61042	NC_017167	CCG	2	6	3119298	3119303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136988
61043	NC_017167	TTC	2	6	3119354	3119359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136988
61044	NC_017167	CCG	2	6	3119369	3119374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136988
61045	NC_017167	ACG	2	6	3119393	3119398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136988
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61047	NC_017167	GC	3	6	3119491	3119496	0 %	0 %	50 %	50 %	384136988
61048	NC_017167	GCC	2	6	3119507	3119512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136988
61049	NC_017167	GCC	2	6	3119527	3119532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136988
61050	NC_017167	CAT	2	6	3119589	3119594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136989
61051	NC_017167	TCC	2	6	3119634	3119639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136989
61052	NC_017167	GCCACG	2	12	3119691	3119702	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384136989
61053	NC_017167	TCC	2	6	3119751	3119756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136989
61054	NC_017167	GGT	2	6	3119785	3119790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136989
61055	NC_017167	CCG	2	6	3119828	3119833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136989
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61057	NC_017167	ACCGC	2	10	3119929	3119938	20 %	0 %	20 %	60 %	384136989
61058	NC_017167	TCCG	2	8	3119990	3119997	0 %	25 %	25 %	50 %	384136989
61059	NC_017167	CG	3	6	3120001	3120006	0 %	0 %	50 %	50 %	384136989
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61063	NC_017167	GCCG	2	8	3120137	3120144	0 %	0 %	50 %	50 %	384136989
61064	NC_017167	CTC	2	6	3120185	3120190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136989
61065	NC_017167	CGT	2	6	3120203	3120208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136989
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61067	NC_017167	CGA	2	6	3120263	3120268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136989
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61069	NC_017167	GCA	2	6	3120316	3120321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136989
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61073	NC_017167	CGT	2	6	3120415	3120420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136989
61074	NC_017167	GC	3	6	3120481	3120486	0 %	0 %	50 %	50 %	384136989
61075	NC_017167	TCGCC	2	10	3120490	3120499	0 %	20 %	20 %	60 %	384136989
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61077	NC_017167	GATC	2	8	3120562	3120569	25 %	25 %	25 %	25 %	384136989
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61083	NC_017167	CG	4	8	3120883	3120890	0 %	0 %	50 %	50 %	384136989
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61089	NC_017167	CGCGC	2	10	3121376	3121385	0 %	0 %	40 %	60 %	384136990
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61099	NC_017167	TCCG	2	8	3121868	3121875	0 %	25 %	25 %	50 %	384136991
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61103	NC_017167	CCGC	2	8	3122052	3122059	0 %	0 %	25 %	75 %	384136991
61104	NC_017167	TGA	2	6	3122098	3122103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136991
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61107	NC_017167	GAA	3	9	3122180	3122188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136991
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61111	NC_017167	CGA	2	6	3122365	3122370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136991
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61114	NC_017167	TCA	2	6	3122461	3122466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136991
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